毕文健


image.png


姓名:毕文健

职称:研究员、助理教授

邮箱:wenjianb@pku.edu.cn

联系地址:北京大学医学部,学院路38号,中心实验楼905


个人简介

毕文健,北京大学基础医学院医学遗传学系课题组长,预聘制助理教授,研究员,北京大学博雅青年学者,博士生导师,国家级青年高层次人才计划入选者。2010年本科毕业于四川大学数学学院,2015年博士毕业于中国科学院数学与系统科学院研究院,2015年至2018年在美国圣裘德儿童研究医院从事博士后研究,2018年至2021年在美国密歇根大学从事博士后研究,20216月入职北京大学基础医学院。

主要工作涉及统计遗传学、生物统计与系统生物学、生物信息学等,针对基因-环境交互作用、生存数据和多分类表型数据设计了多种快速、准确的分析算法,并应用于UK Biobank等大型生物样本库的实际数据中。以第一/共同第一作者身份发表于Nature Genetics (2022), American Journal of Human Genetics (2019, 2020, 2021, 2023)Genetics, Biostatistics等学术杂志。


主要研究方向

随着高通量测序技术、高精度成像技术以及电子健康记录系统的发展,生物医学进入了健康医疗信息化的大数据新时代。海量的生物医学大数据为系统生物学研究提供了丰富的研究资源。比如英国生物样本库收集了50万英国人的健康数据并向全球科研人员开放,其中包含基因测序、脑部扫描成像、临床指标、生活方式等多维度数据。基于生物医学大数据的分析对于精准医疗、个体化治疗具有重要的研究意义。


我们的研究工作涉及生物医学大数据分析、统计遗传学和系统生物学。主要包括:


1. 提出适用于生物医学大数据的统计遗传学算法,并应用于实际数据分析,挖掘与复杂疾病与复杂表型相关的遗传学位点;

2. 提出普适性的针对混杂种群与遗传亲缘性的GWAS算法,并应用于实际数据分析,挖掘与复杂疾病与复杂表型相关的遗传学位点;

3. 针对罕见变异位点提出聚合分析方法,用于分析复杂表型;

4. 提出针对基因-环境交互的全基因组关联分析。


代表性研究成果

*Corresponding Author #Co-first author

1.Wei Zhou#* Wenjian Bi#*, Zhangchen Zhao#, Kushal K. Dey, Karthik A. Jagadeesh, Konrad J. Karczewski, Mark J. Daly, Benjamin M. Neale, Seunggeun Lee*, Set-based rare variant association tests for biobank scale sequencing data sets. Nature Genetics, 2022, 54(10): 1466-1469.


2.Wenjian Bi#*, Wei Zhou#, Peipei Zhang, Yaoyao Sun, Weihua Yue, Seunggeun Lee*. Scalable mixed model methods for set-based association studies on large-scale categorical data analysis and its application to exome sequencing data in UK Biobank, American Journal of Human Genetics, 2023, 110(5): 762-773.


3.Yaoyao Sun, Yuyanan Zhang, Zhe Lu, Hao Yan, Liangkun Guo, Yundan Liao, Tianlan Lu, Lifang Wang, Jun Li, Wenqiang Li, Yongfeng Yang, Hao Yu, Luxian Lv, Dai Zhang, Wenjian Bi*, Weihua Yue*, Longitudinal Network Analysis Reveals Interactive Change of Schizophrenia Symptoms During Acute Antipsychotic Treatment. Schizophrenia Bulletin, 2022, https://doi.org/10.1093/schbul/sbac131.


4.Wenjian Bi*, Wei Zhou, Rounak Dey, Bhramar Mukherjee, Joshua N. Sampson, Seunggeun Lee*, Efficient mixed model approach for large-scale genome-wide association studies of ordinal categorical phenotypes. American Journal of Human Genetics, 2021, 108(5): 825-839.


5.Wenjian Bi, Lars G. Fritsche, Bhramar Mukherjee, Sehee Kim, Seunggeun Lee*, A fast and accurate method for genome-wide time-to-event data analysis and its application to UK-Biobank. American Journal of Human Genetics, 2020, 107(2): 222-233.


6.Wenjian Bi, Zhangchen Zhao, Rounak Dey, Lars G Fritsche, Bhramar Mukherjee, Seunggeun Lee*, A fast and accurate method for genome-wide scale phenome-wide G×E analysis and its application to UK Biobank. American Journal of Human Genetics, 2019, 105(6): 1182-1192.


7.Wenjian Bi, Yun Li, Matthew P. Smeltzer, Guimin Gao, Shengli Zhao, Guolian Kang*, STEPS: an efficient prospective likelihood approach to genetic association analyses of secondary traits in extreme phenotype sequencing. Biostatistics, 2020, 21(1): 33-49.


8.Guolian Kang#*, Wenjian Bi#, Hang Zhang, Stanley Pounds, Cheng Cheng, Sanjay Shete, Fei Zou, Yanlong Zhao, Ji-Feng Zhang, Weihua Yue*, A robust and powerful set-valued approach to rare variant association analyses of secondary traits in case-control sequencing studies. Genetics, 2017, 205(3): 1049-1062.